迄今为止最古老的人类基因组已被测序,这是丹尼索瓦人的基因组

(uux.cn亚历山大·克里亚舍夫/俄罗斯卫星通讯社通过美联社)据《科学》杂志(安·吉本斯):周二下午,当人口遗传学家Stéphane Peyrégne在墨西哥巴亚尔塔港的一次会议上发表演讲时,谣言已经传开,礼堂里挤满了人。
他没有让人失望:我很高兴告诉你一个来自20万年前男性的新丹尼索瓦人基
【菜科解读】
俄罗斯考古学家深入丹尼索瓦洞穴,发现了一颗产生新基因组的臼齿。
(uux.cn亚历山大·克里亚舍夫/俄罗斯卫星通讯社通过美联社)据《科学》杂志(安·吉本斯):周二下午,当人口遗传学家Stéphane Peyrégne在墨西哥巴亚尔塔港的一次会议上发表演讲时,谣言已经传开,礼堂里挤满了人。
他没有让人失望:我很高兴告诉你一个来自20万年前男性的新丹尼索瓦人基因组,马克斯·普朗克进化人类学研究所的博士后Peyrégne说。
他公布的基因序列是迄今为止最古老的高质量人类基因组,比之前的记录保持者——生活在大约12万年前的尼安德特人——早8万年。
经过十多年的努力,我们找到了丹尼索瓦人的骨骼化石和第二个基因组,这是14年前通过DNA发现的神秘的古代人类。
第一个丹尼索瓦人的基因组来自一个女孩的小指骨,年代在6万到8万年前。
丹尼索瓦人和古代尼安德特人的基因组都来自同一个寒冷、化石丰富的地点:西伯利亚阿尔泰山脉的丹尼索瓦洞穴。
根据Peyrégne及其同事的分析,新测序的雄性来自一个独特的早期丹尼索瓦人群体,该群体与一组尼安德特人多次杂交,而尼安德特人的群体以前从未在DNA中检测到。
布朗大学的人口遗传学家Emilia Huerta Sanchez说:作为一个在过去十年中一直在思考丹尼索瓦人的人,新丹尼索瓦基因组的消息令人难以置信地激动人心。
她在分子生物学与进化学会年会上共同组织了这次会议。
这不仅仅是另一个古老的基因组,加州大学伯克利分校的人口遗传学家Priya Moorjani补充道,他也参加了这次演讲。
它告诉了更多关于这些难以捉摸的祖先的信息。
丹尼索瓦人主要通过DNA来识别。
研究人员已经获得了这名女孩的基因组,以及来自另外七名个体的零碎化石(牙齿、脚趾骨)的核和线粒体DNA片段,这些化石都来自丹尼索瓦洞穴。
科学家们还发现了一些丹尼索瓦人的DNA,包括巴布亚人和汉族人,这些DNA是从过去的杂交中获得的。
沉积物中的DNA显示,丹尼索瓦人最早是在30万年前进入这个洞穴的,后来住在青藏高原的一个洞穴里。
这些稀少的化石表明,这个古老的人类比尼安德特人有更大的臼齿,还有一张强壮的下脸,这是从中国的一块颚骨上发现的。
但没有人真正知道丹尼索瓦人长什么样。
Peyrégne在他的演讲中报道,丹尼索瓦洞穴的挖掘工作仍在继续,俄罗斯科学院(RAS)的考古学家Maxim Kozlikin在20万年前的深层发现了一颗臼齿。
RAS团队将这颗臼齿送往马克斯·普朗克,进化遗传学家在那里提取了足够的DNA,以提供24倍的基因组覆盖率,这被认为是这种旧DNA的例外。
Peyrégne及其同事在计算生物学家Janet Kelso的实验室工作,将新的DNA序列与尼安德特人、其他丹尼索瓦人和现代人的DNA序列进行了比较。
DNA分析显示,丹尼索瓦男性从一个古老的、以前未知的尼安德特人群体中继承了5%的基因组。
这只雄性被标记为丹尼索瓦25,来自与女孩不同的丹尼索瓦人群体,即丹尼索瓦3号,以及洞穴中的其他丹尼索瓦族人。
这名女孩的DNA与现存现代人的丹尼索瓦人序列关系更密切,他们从至少两个丹尼索瓦人口中获得了这些序列。
佩蕾涅在演讲中说,所有这些都表明,洞穴中年长的雄性种群被后来的丹尼索瓦人所取代。
数据还表明,丹尼索瓦人的男性祖先曾多次与尼安德特人杂交。
根据大约12万年前的尼安德特人化石,丹尼索瓦人在洞穴中显然被尼安德特人取代了一段时间。
然而,到大约6万年前,丹尼索瓦人已经搬了回来。
这两个群体甚至可能在洞穴里见过面——一名5万岁以上女性的骨骼片段的DNA显示,她的母亲是尼安德特人,父亲是丹尼索瓦族人。
后来,DNA和化石都表明现代人类占领了这个洞穴,丹尼索瓦人和尼安德特人消失了。
佩蕾涅在演讲中说,该地区显然是各种类型人类的十字路口。
尽管丹尼索瓦人和尼安德特人显然是反复杂交的,但他们的谱系是不同的:他们至少在40万年前从一个共同的祖先分化而来。
根据新的基因组,尼安德特人的祖先定居在欧洲和中东,而丹尼索瓦人则向更远的东方进入亚洲,在那里他们分别进化,获得了大约30万个基因变化,将他们与尼安德特人区分开来。
Peyrégne在他的演讲中说:尼安德特人和丹尼索瓦人仍然处于不同的群体中,并在地理范围的边缘混合在一起。
#p#分页标题#e#在问答环节,一位观众问,这名男性的基因组是否也有一种更古老、身份不明的人类的DNA——也许是直立人——其DNA已在丹尼索瓦女孩的基因组中被发现。
Peyrégne回应道:如果有任何丹尼索瓦人的超级祖先,它也存在于这个基因组中。
。
[该DNA]由丹尼索瓦3号和丹尼索瓦25号共享。
马克斯·普朗克研究人员计划很快公布新的基因组。
Moorjani说:从这个神秘的群体中再获得一个基因组真的很令人兴奋。
中国十大最受欢迎动物园,广州长隆野生动物世界领跑
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基地内以模拟大熊猫野外生态环境的形式打造,包含了大熊猫产房、熊猫饲养区、科研中心、熊猫医院,以及若干处豪华熊猫“别墅”散落于山林之中。
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古物种学家发现一种新的鱼类化石
致谢:uux.cn莫里茨·迪伦伯格据慕尼黑路德维希·马克西米利安大学:虾虎鱼是欧洲种类最丰富的海洋和淡水鱼类之一。
它们一生中的大部分时间都生活在浅水水体的底部,对许多生态系统的功能做出了重大贡献。
随着一种淡水虾虎鱼化石新属的确定,LMU大学地球生物学和古生物学国际硕士项目的学生和LMU大学地球与环境科学系教授古生物学家Bettina Reichenbacher的发现为这些鱼类的进化史提供了重要的见解。
这一发现发表在《系统古生物学杂志》上。
新属Simpsonigobius的小鱼体长可达34毫米,是在土耳其1800万年前的岩石中发现的,具有独特的形态特征组合,包括形状独特的耳石(听力石)。
现代研究技术阐明了在家谱中的位置为了确定Simpsonigobius在虾虎鱼类系统发育树中的关系,研究人员利用了一个总证据系统发育数据集,他们对该数据集进行了增强,以结合来自48个现存物种和10个化石物种的5个基因的总共48个形态特征和遗传数据。
此外,研究小组首次对虾虎鱼化石物种进行了尖端测年。
这是一种系统发育方法,其中包括在系统发育树中的化石年龄(= tips)用于推断整个群体进化历史的时间。
研究结果表明,这个新属是虾虎鱼科中最古老的成员——该科被归类为现代虾虎鱼(虾虎鱼科和背眼虾虎鱼科)——也是这一现代群体中最古老的淡水鮈。
尖端年代测定分析估计虾虎鱼科出现在3410万年前,背眼虾虎鱼科出现在3480万年前,这与以前使用其他方法进行的年代测定研究一致。
此外,研究人员首次将化石虾虎鱼纳入随机栖息地制图,揭示了虾虎鱼在进化史之初可能具有广泛的盐度耐受性,这挑战了以前的假设。
Simpsonigobius的发现不仅为虾虎鱼增加了一个新属,还为这些不同鱼类的进化时间表和栖息地适应提供了重要线索。
Reichenbacher说:我们的研究强调了使用现代方法分析化石记录的重要性,以更准确地了解进化过程。
第一作者Moritz Dirnberger目前是蒙彼利埃大学的博士生,他补充说,这些发现有望为进一步研究虾虎鱼的进化以及环境因素在塑造其多样性中的作用铺平道路。