人类科学界公认的125个未解之谜源于2005年美国《科学》杂志为纪念创刊125周年发布的“125个科学前沿问题”清单，涵盖了从宇宙本质到生命起源的核心难题。

1. 宇宙相关宇宙由什么构成：已知宇宙大部分质量由难以直接观测的暗物质构成，暗能量则推动宇宙加速膨胀，但具体成分和性质不明。

宇宙是否唯一：目前不清楚我们所在的宇宙是独一无二的，还是存在多元宇宙。

是什么驱动宇宙膨胀：科学家发现宇宙在加速膨胀，但对于推动这种膨胀的能量来源（暗能量）的本质了解有限。

黑洞的本质是什么：黑洞具有强大引力，连光都无法逃脱，其内部的物理规律和结构仍是未解之谜。

正物质为何多于反物质：在宇宙诞生之初，理论上正物质和反物质应等量产生，但现实中正物质占主导，原因未知。

2. 生命科学相关意识的生物学基础是什么：不清楚意识究竟是大脑活动的结果，还是某种更深层次的存在。

为什么人类基因会如此之少：人类的基因数量相对较少，但却展现出高度的复杂性和智能，其具体机制有待研究。

遗传变异与人类健康的相关程度如何：尚未明确遗传变异在多大程度上影响人类健康及疾病的发生发展。

是什么控制着器官再生：一些生物具有强大的器官再生能力，而人类的再生能力有限，控制器官再生的机制尚不明确。

地球生命在何处产生、如何产生：地球上的生命如何从无机物中诞生的过程仍不明确。

3. 物理相关物理定律能否统一：广义相对论和量子力学分别在宏观和微观领域取得成功，但如何将二者统一是理论物理的一大难题。

量子不确定性和非局部性背后是否有更深刻的原理：量子力学中一些奇特现象背后可能存在更基本的物理规律等待发掘。

重力的本质是什么：虽然牛顿和爱因斯坦对重力有不同的解释，但重力的本质和产生机制还有待深入探究。

时间为何不同于其他维度：时间具有单向性等独特性质，与空间维度有明显区别，其原理尚未明确。

是否存在比夸克更小的基本粒子：目前夸克被认为是基本粒子，但不能排除存在更小构成单元的可能。

这份清单虽已发布近二十年，但其提出的问题仍是当今科学界致力攻克的核心方向，后续科学进展如引力波的发现等均与之紧密相关。